biochemia 2013.docx

Enzymy:

wybierz odpowiednie przypasowanie koenzym-witamina, otwarte-co to jest stała michaelisa.

1) wymien glowne cechy katalizy enzymatycznej 2) podaj klasy enzymow i schematy katalizowanych przez nie reakcji

jakie czynniki wpływają na szybkość reakcji enzymatycznej, opisz oraz co to jest cetrum aktywne enzymu

1) CoA z jakimi grupami ma do czynienia, odp. acylowymi (zamknięte)
2) Czym są rybozymy (otwarte)

Uzupełnić jednostki w zdaniu o jednostce aktywnosci katalitycznej U, klasy enzymów (testowe, czy dobre przyporządkowanie)

1) co to jest stała Michaelisa? przedstaw ją graficznie na wykresie.
2) co to jest inhibicja niekompetycyjna?

1. Opis inhibitora (jego oddziaływanie na Km i vmax) i dopisać kompetycyjny/niekompetycyjny.
2. Definicja aktywności właściwej i czego jest ona miarą.

1. Opisz czynniki wypływające na szybkość reakcji enzymatycznych.
2. Opisz czym sa izoenzymy

1. Jakie grupy przenosi tetrahydrofolian (zamknięte)
2. Podaj schemat ogólny reakcji katalizowanej przez transferazy/syntetazy.

1. Czym jest inhibicja nieodrwacalna?
2. Rola enzymów allosterycznych.

1.Działanie enzymu na stałą K.
2.Stała Michaelisa definicja i o czym świadczy

1. Opisz rodzaje inhibicji.
2. Opisz, co to jest centrum aktywne enzymu.

Sacharydy:

- podaj enzym, którego brak powoduje fruktozemie i zapisz katalizowaną przez niego reakcję (schemat);
- zapisz reakcje (schemat) katalizowaną przez fosfofruktokinazę w glikolizie i wypisz aktywatory oraz inhibitory tego enzymu

1) opisz co sie dzieje przy niedoborze transferazy urydylowej 2) narysuj schemat reakcji nieodwracalnej cyklu pentozofosforanowego ''wszystkie enzymy, produkty, substraty, pełne nazwy''

dzięki przemianie pirogronian w mleczan glikoliza zachodzi w warunkach. ... odp beztlenowych. oraz reakcja fosfoenolopirogronian w pirogronian jaki enzym

testowe o inhibitory/aktywatory fruktokinazy, wpisać ile węgli mają grupy, które przenoszą transketolaza/transaldolaza

1) napisz i narysuj schematycznie produkty przemian pirogronianu i podaj enzymy uczestniczące w reakcjach (z tym 'rysowaniem' to nie wiem o co chodziło, bo wystarczyło nazwać związek).
2) opisz fruktonurię (powody, przebieg, itp). i tu niespodzianka, gdyż wg wykładów fruktonuria jest powodowana brakiem aldolazy B, a wg p. Mrowickiej powodowana brakiem/niedoborem fruktokinazy

1. Napisz schemat przemiany fruktozy w mięśniach i tkance tłuszczowej. ( i tutaj taka zabawa, że na wykładzie był schemat, który zachodzi w wątrobie, a w mięśniach jest inny
2. Wypisz 4 enzymy, które ulegają ragulacji w cyklu glukoneogenezy. Wypisz inhibitory i aktywatory enzymu, który działa w mitochondrium

1.Dla reakcji katalizowanych przez jaki enzym glukozo-6-fosforan jest substratem? 2. schemat reakcji: pirogronian + NADH+ --- X ----> E + NAD+

1. Podać znaczenie szlaku pentozowego w anemii hemolitycznej.
2. Jaki enzym katalizuje reakcje pirogronianu w mitochondrium? (czy jakoś tak było sformułowane, chodziło o karboksylazę pirogronianową) W jakiej postaci pirogronian jest transportowany do cytoplazmy? nazwa enzymu+substraty+produkty

1. produktem szlaku pentozowego jest rybozo-5-fosforan 2. transketolaza przenosi fragmenty dwuwęglowe 3. NADH uzywane jest do syntezy kwasów tłuszczowych 4. transaldolaza przenosi fragmenty 3-weglowe z aldozy na ketoze –które zdania prawdziwe?

albo napisać inhibitor fosfofruktokinazy, a w drugiej grupie , napisać ktorego enzymu aktywatorem jest 1,6(albo 2,6)bisfosforan czy jakos tak i też chodzilo o fosfofruktokinaze

Lipidy:

brak jakiego enzymu występuje w chorobie Niemanna-Picka i jak wpływa insulina na lipolizę.

za co odpowiada acylotransferaza karnitynowa II i jaka jest różnica w budowie prostaglandyn i tromboksanów.

Jaką reakcje katalizuje ketotiolaza? Wymień 3 ciała ketonowe (k. acetooctowy, beta-hydroksymaślan i aceton)

1. Rola fosfatydyloetanoloaminy; 2. Enzym, który umozliwia przejscie acetyloCoA w malonyloCoA

jakie enzymy tworzą kompleks syntazy kwasów tłuszczowych. Ale inni mieli o enzymy w beta-oksydacji (też JEDNO pytanie za DWA punkty).

Jaką reakcje katalizuje tiolaza? Co się dzieje z kwasami tłuszczowymi po rozpadzie gricerydu? (dostałam pkt za odowiedz: łączą się z albuminami osocza)

1.Wymień trzy glicerolipidy eterowe (plazmalogen cholinowy,etanoloaminowy, PAF) 2.Wymień miejsca w komórce, gdzie syntetyzowany jest cholesterol - cytozol, SER.

jaki enzym zamienia acetylo CoA w malonylo CoA i drugie: co to jest i co robi glicerofofoetanoloamina.

1. Działanie aspiryny
2. Co to jest kardiolipina

1. główny enzym syntezy cholesterolu. 2. jakie znasz eikozanoidy. napisz roznice w budowie tromboksanu i prostaglandyn.

1.Jakie hormony regulują lipolizę? (Insulina, glukagon, adrenalina) 2.Funkcja karnityny (transport gr acylowych do mitochondrium z cytosolu; pośredni etap B-oksydacji)

miejsce syntezy kwasów tłuszczowych w komórce i miejsce b oksydacji, wpływ wysokiego stężenia glukozy na b oksydacje

Główne produkty/substraty(2. grupa) podczas biosyntezy cholesterolu (3 pierwsze reakcje).
Odpowiedź wg prowadzącego: substraty: acetylo-CoA, acetacetylo-CoA, HMG-CoA.

wpływ glukozy na B oksydację
różnice między B oksydacją, a syntezą kwasów tłuszczowych

1. wyjaśnij co oznacza zapis 19:3 cis 9,13,15;
2. wymień lipoproteiny osocza;

1. Jakie reakcje katalizuje lipooksygenaza
2. Co się dzieje z kwasami tłuszczowymi po rozpadzie glicerydu

1. Wymień eikozanoidy i przedstaw rożnicę w budowie tromboksanów i prostaglandyn.
2. Opisz przemiany glicerolu do fosfodihydroksyacetonu.

1. jakie stężenia cytrynianu sprzyjają beta oksydacji a jakie syntezie
2. W jakich komórkach i dokładnie gdzie zachodzi synteza kwasów tłuszczowych

1. Niedobór lub brak jakiego enzymu powoduje chorobę Taya-Sachsa. 2. Jak wpływa stężenie c-AMP na syntezę kwasów tłuszczowych de novo.

1. Wyjaśnij co oznacza zapis 20:4 cis 5, 8, 11, 14
2. W jaki sposób jest dziedziczony jest zespół Bartha

enzymy uczestniczące w beta-oksydacji kwasów nienasyconych

1.opisz wplyw stezenia cytrynianu na synteze kw.tluszczowych 2.wymien 2pierwsze enzymy I etapu B-oksydacji w macierzy mitochondrium.

zespół bartha i za co odpowiada karnityna I

1.co jest donorem gr,metylowej w syntezie fosfatydyloacetylocholiny z fosfatydyloetanoloaminy ; 2.wymien 2 elementy z kompleksu syntaz kwasow tłuszczowych

co jest donorem gr karboksylowej dla karboksylazy acetyloCoA ( biotyna); wpływ stężenia cytrynianu na B-oksydacje

podaj przykład półniezbędnego kwasu tłuszczowego (kwas arachidonowy), jakiego enzymu brakuje w chorobie Gauchera(glukocerebrozydaza)

1.       Gdzie zachodzi poboczna synteza trójgliceroli
2. Opisać proces przemiany glicerolu w fosfodihydroksyaceton

Cykl Krebsa:

pytania testowe - pierwsze co robi dinitrofenol, drugie wybrać odpowiednie produkty reakcji do podanych enzymów, np. dehydrogenaza pirogronianowa i acetylo-CoA plus były jeszcze 2 enzymy, wszystko dot. cylku Krebsa

opisać hipotezę teorii chemiosmotycznej/ cykl jałowy 2. z jakich eznymów i koenzymów składa się kompleks dehydrogenazy pirogronianowej/ a-KG.

1. W którym ze związków występuje wysokoenergetyczne wiązanie tioestrowe?

2. Wybrać odp substrat, enzym i produkt reakcji: bursztynian + X --E---> fumaran + Y

wiązanie acylofosforowe

1) koenzymy kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej (a,b,c...)
2) uszeregować w kolejności pojawiania się w cyklu Krebsa dehydrogenazy (a,b,c...)

-uszeregować związki wedługo powstawania w cyklu Krebsa
-enzymy kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej. Zwróćcie uwagę na końcówki (dehydrogenaza dihydroliponianowa i dihydroliponoamidowa to to samo), bo było tak skonstruowane, że mogło wprowadzić w błąd

- co powodują związki rozprzęgające (wyrównanie stężenia protonów wodorowych po obu stronach wewnętrznej błony mitochondrialnej)
- przy jakim enzymie cyklu Krebsa zachodzi fosforylacja substratowa (syntetaza sukcynylo-CoA = tiokinaza bursztynianowa)

-uszeregować związki wedługo powstawania w cyklu Krebsa
-enzymy kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej
testowe.

Grupy 15 i 16 - obydwa testowe: 1. Wskazać związek, w którym występuje wysokoenergetyczne wiązanie acylofosforanowe. (1,3-bisfosfoglicerynian) 2. Wskazać reakcję nieodwracalną cyklu Krebsa (a-ketoglutaran -> bursztynylo-CoA)

wybrać związki hamujące działanie dehydrogenazy pirogronianowej, a w drugim była tabelka i trzeba było wybrać odpowiednie przyporządkowanie produktów do podanych enzymów (była dehydrogenaza izocytrynianowa i dehydrogenaza alfa-ketoglutaranowa), obydwa zamknięte

Aminokwasy:

1.co powstaje w reakcji pirogronian+glutaminian odp alfaketoglutaran+alanina 2.podane zdania na temat degradacji białek, polecenie-zaznacz fałszywe, odpowiedz-wszystkie są prawidłowe. oba pytania testowe

1. podać dwa związki, będące prekursorami glicyny 2. co powstaje z 5-hydroksytryptofanu (serotonina)

1. Pochodną którego aminokwasu jest melatonina. Jakich zwiazków prekursorem jest DOPA a) noradrenalina b) dopamina (chyba) c) obie poprawne.

Pytania testowe z seminarium o aminokwasach, 28.I.2013r.

1.              Podaj alfa-ketokwasy będące produktem transaminacji podanych aminokwasów:

a.              Alanina – pirogronian

b.              Asparaginian – szczawiooctan

c.              Glutaminian – alfa-KG

d.              Leucyna – alfa-ketoizokapronian

e.              Fenyloalanina – fenylopirogronian

f.              Tyrozyna – hydroksyfenylopirogronian

2.              Które z wymienionych AA są egzogenne?

a.              Alanina

b.              Asparaginian

c.              Glutaminian

d.              Leucyna + (AA rozgałęziony)

e.              Fenyloalanina + (AA pierścieniowy)

f.              Tyrozyna (powstaje z AA dostarczanych w pokarmie, budowa pierścieniową i –OH)

3.              Które z wymienionych AA są endogenne?

a.              Cysteina + (ma siarkę)

b.              Asparaginian + (kwaśny, NIE jest amidem)

c.              Glicyna + (najmniejszy AA, ma 2 atomy węgla)

d.              Treonina

e.              Metionina

f.              Tryptofan

4.              Enzymy trzustkowe to: trypsyna, chymotrypsyna, elastaza. Pepsyna NIE.

5.              Zdania fałszywe o melatoninie:

a.              Syntetyzowana w szyszynce

b.              Syntetyzowana w nadnerczach +

c.              Kontroluje rytm dobowy

d.              Jest oligopeptydem +

e.              Związana z receptorami TRPV4 + (receptory TRPV mają kanały jonowe, są odpowiedzialne m.in. za ból, np. kapsaicyna w chili)

6.              Które AA zawierają siarkę?

a.              Homocysteina +

b.              Asparagina

c.              Glicyna

d.              Treonina

e.              Homoseryna

f.              Metionina +

7.              Zaznacz prawidłowe zdania odnoszące się do glutationu (Glu Cys Gly)

a.              Chroni erytrocyty przed utlenieniem +

b.              W większości komórek stężenie formy zredukowanej GSH jest większe niż formy utlenionej GSSG +

c.           ...